吾妻駅は、長崎県雲仙市吾妻町牛口に所在する。吾妻の中心部で、住宅が多い。駅前に商店もある。雲仙市役所（旧・吾妻町役場）の最寄り駅となっている。所属路線は島原鉄道島原鉄道線。急行が停車する駅です。
相対式ホーム2面2線を有する地上駅。長方形ののっぺりとした木造駅舎です。二つのホームは互い違いに設置されており、南側のホームが古部方、北側のホームが阿母崎方にずれている。二つのホームは構内中ほどの構内踏切（遮断機・警報機なし）で結ばれている。駅前には大きな自転車置場が設置されています。
南側のホームの阿母崎方、南側に接して駅舎が、北側のホームの中程には待合所が置かれている。駅舎は一階建てで、内部にはトイレ（水洗式）、待合所、駅事務室がある。駅舎のほか、北側の待合所の古部方から駅の外に出る階段も設置されており、駅の出入口となっている。待合室には広告入りの木製長椅子が設置されています。
有人駅。駅舎内の窓口で乗車券等の販売を行っている。窓口営業時間は、7時から18時までです。
1912年（大正元年）10月10日 - 山田村駅（やまだむらえき）として開業。
1960年（昭和35年）11月5日 - 吾妻駅に改称。
1966年（昭和41年）2月1日 - 業務委託化。
1970年（昭和45年）6月30日 - 貨物営業廃止。
所属事業者 島原鉄道
所属路線 ■島原鉄道線
キロ程 16.6km（諫早起点）
駅構造 地上駅
ホーム 2面2線
乗降人員
-統計年度- 401人/日
-2005年度-（2005年度、島原鉄道線内44駅中第8位）
開業年月日 1912年（大正元年）10月10日
